如今，智能手机应用程序被全世界所有人使用。
潜伏着一种不为人知的存在，叫做应用程序兽人，俗称“应用程序兽”。
应用程序兽是具有人工智能的应用程序生命体，可以独立思考和行动。
在人类世界和数字空间的间隙中，为系统和人类运作。
但是，在互联网的海洋中潜伏着“凶猛的最终BOSS人工智能利维坦”。
变成病毒控制了应用程序兽，并开始入侵各种系统。
试图从网络方面控制人类世界。
主角少年新海纯，
得到了伟大意志引导的“应用程序驱动程序”，
来自“应用程序芯片”的搜索应用程序·GATCHIMON已经实体化。
“应用程序驱动程序”中隐藏的谜团，
应用程序兽中隐藏的网络世界和现实世界之间的不可思议的“领域”，
而两个应用程序兽进化的“应用程序融合”究竟是什么？ “利维坦”的真正目的到底是什么……！？
爱读书的少年Haru和搜索应用程序的怪物GATCHIMON……
